La colección del Museo Diocesano de Santiago de Compostela reúne una parte importante del patrimonio mueble perteneciente a la Archidiócesis de Santiago de Compostela. 

Gran número de piezas proceden de parroquias de la diócesis, bien porque cayeron en desuso o porque no se disponía de los medios para su conservación. Estas piezas fueron depositadas en San Martín Pinario, en donde llegaron a ser expuestas de forma temporal o puntual. Otras piezas son de instituciones vinculadas a este museo, como el Museo de la Catedral o la propia catedral de Santiago, mientras que otras fueron realizadas ex profeso para el Diocesano. Asimismo, se suman los fondos del inmueble que acoge este museo, el antiguo Monasterio de San Martín Pinario y el Seminario Mayor que lo ocupó desde el año 1829. 

La mayor parte de la colección del Museo Diocesano la constituyen piezas de arte sacro, aunque está compuesta por piezas de naturaleza diversa, desde la época medieval hasta la contemporaneidad: escultura religiosa en distintos materiales (madera, piedra, marfil o alabastro), pintura (representación de escenas religiosas, temática jacobea o retratos de figuras eclesiásticas), artes decorativas, orfebrería y objetos litúrgicos (platería, copones, portapaces o cruces procesionales). Además, la sección más antigua de esta colección es de naturaleza arqueológica, ya que posee una colección de laudas sepulcrales relacionadas con la historia de Santiago y de la catedral.