El Consello da Xunta en su reunión de 26 de enero de 2017 reconoció la Casa de la Navegación de Baiona como centro museístico. Con este reconocimiento de la Casa de la Navegación de Baiona como colección visitable, son 19 las colecciones y 2 los museos reconocidos por la Xunta de Galicia desde el año 1995 en el que se aprobó la primera Ley del Patrimonio Cultural de Galicia. En ella se establece que la creación, autorización y calificación de un museo o colección visitable en Galicia se hará por acuerdo del Consello da Xunta.

La Casa de la Navegación de Baiona es un centro museístico de titularidad municipal situado en el casco histórico de Baiona, en la conocida cómo Casa Carvajal. Este nuevo centro da cuenta del papel trascendental de Baiona en la historia de la navegación atlántica y tiene como complemento la visita a la réplica de la Carabela Pinta, situada en el puerto, testigo del hito histórico de la arribada de esta embarcación a la villa en 1493 tras el descubrimiento de América.

La exposición se desarrolla en las dos plantas del edificio. En la planta baja se muestra la evolución histórica, urbana y social de la Real Villa de Baiona. La planta superior está dedicada al papel protagonista de su puerto en la actividad pesquera y comercial, así como a la vida y a la muerte en el mar con los vestigios de naufragios y batallas contra corsarios, piratas y armadas extranjeras.

Tal y como se recoge en el reglamento interno de la Casa de la Navegación: "La misión de esta colección visitable es la protección, conservación, documentación, investigación y difusión de los bienes materiales e inmateriales del patrimonio cultural, vinculado con el puerto y con la Villa de Baiona en el contexto de la navegación atlántica, y con un conocimiento profundo de su evolución, en especial del papel que su puerto jugó en la conformación urbanística y social de la villa".

La colección es multidisciplinar pero destacan los fondos de carácter arqueológico procedentes de intervenciones en su casco histórico así como del dragado del puerto de Baiona. Se trata fundamentalmente de material cerámico que llegaba a través del comercio marítimo desde antiguo,  como así lo manifiestan la cántara andalusí y las jarras normandas medievales. De esta época son también la tapa de sarcófago del cementerio medieval de Santa Liberata que muestra signos relativos a la actividad marinera del difunto, monedas de los siglos XIII al XV y menaje funerario. La exposición se completa con portulanos antiguos donde aparece mencionado el puerto de Baiona, piezas y documentos alusivos a la Arribada de la Carabela Pinta, artes de pesca y referencias a la población marinera de la villa, objetos y manuales de navegación, y fotografías y piezas que ilustran naufragios en la costa de Baiona, como los cañones de un pecio de Cabo Silleiro del siglo XVII.